共同パートナーシップにより、サンプル追跡ソフトウェアをクラウドで提供

産業

技術情報

はじめに

私たちは、研究所に特注のソフトウェア・ソリューションを提供し、チームメンバーがエンド・ツー・エンドで受け取ったサンプルをすべて追跡できるようにしました。

ウェルカム・サンガー研究所について

ウェルカム・サンガー研究所は、科学と医学を変えるヒトと病原体の生物学への洞察を提供するゲノム研究の世界的リーダーである。ケンブリッジシャーにあるウェルカム・ゲノム・キャンパスは、基礎および応用ゲノム研究の世界的な中心地である。

課題

ウェルカム・サンガー研究所は、「生命の樹」プログラムのもと、イギリスとアイルランドに生息する72,000種の生物のゲノムを解読するイニシアティブを主導している。この大事業には、博物館、植物園、研究機関、大学など、国内の幅広いパートナーから何千ものサンプルを受け取ることが含まれる。

この研究所では、サンプルの記録と追跡を手作業のスプレッドシートやプロセスに頼るのではなく、1つにつき約50の関連メタデータを持つ可能性のあるサンプルを、効率的、迅速かつ効果的に管理し、さまざまな部門のチームメンバーが必要なときにいつでも最新のリアルタイム情報にアクセスできるソフトウェアシステムが必要だった。

当社の取り組み

私たちはまず、総合的なディスカバリー・プログラムを実施し、インスティテュートのチーム・メンバーとともに現状を把握し、望ましい最終状態を完全に理解することから始めました。

10週間でソリューションのMVPが完成し、本稼働の準備が整った。それ以来、私たちは継続的改善の精神に基づき、必要に応じて特定の機能の最適化と強化を続けてきました。例えば、ダウンストリームのシーケンスデータを各サンプルにリンクさせたり、システムの機能を拡張したりしました。

解決策

プライベート・クラウドでホスティングされ、ユーザー・インターフェースは1つ。オープンソース・コード（Python）で書かれ、オープンAPIが使用されているため、システムはメンテナンスが容易で、完全にスケーラブルであり、プログラムのもとで開発されるより広いヨーロッパおよび世界のデータベースに安全に接続することができる。

その結果

プロジェクトのスピード、効率、正確性は大幅に向上し、サンプルはメタデータとともに、以前よりはるかに短時間で記録・記録できるようになった。

手作業によるプロセスやデータ入力がなくなったことで、エラーや不正確さが発生する余地はかなり少なくなった。この研究所は、他のプロジェクトにも簡単に適用できるシステムを導入している。

「NashTechとの仕事は本当に楽しいものでした。彼らは時間をかけてチームと協力し、私たちが何を必要としているかを理解し、プロセスを完全に文書化し、詳細なソリューション・アーキテクチャを作成してくれました。NashTechなしでは、加速されたタイムスケールの中で、現在のような規模に拡大することはできませんでした。”

ケネス・ハウグ、イネーブリング・プラットフォーム・チームリーダー – システムオーナー – ウェルカム・サンガー研究所